Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU7

TET1, Methylcytosine dioxygenase TET1, humanhuman

Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET1Q8NFU7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TET1Q8NFU7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TET1Q8NFU7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms