Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNERQ8NFT8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms