Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGBL3Q8NEM8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGBL3Q8NEM8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms