Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms