Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00116Q8NCU8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms