Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD12Q8N8I0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms