Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM20Q8N5G0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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