Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms