Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC6Q8IVU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms