Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms