Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP1Q7Z6B7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms