Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms