Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms