Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HACD2Q6Y1H2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HACD2Q6Y1H2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms