Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP26C1Q6V0L0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP26C1Q6V0L0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms