Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms