Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms