Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
INTS3Q68E01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS3Q68E01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms