Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF20Q5VTR2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF20Q5VTR2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms