Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms