Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PXDC1Q5TGL8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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