Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC122Q5T0U0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms