Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms