Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39AQ5SRH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39AQ5SRH9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms