Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms