Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms