Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms