Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN3Q4LDR2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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