Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUS10Q3MIT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUS10Q3MIT2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms