Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF20Q3BBV1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms