Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms