Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms