Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL5

SMTNL2, Smoothelin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL2Q2TAL5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMTNL2Q2TAL5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMTNL2Q2TAL5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms