Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIDA1Q1XH10 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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