Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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LY6EQ16553 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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