Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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