Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN9AQ15858 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN9AQ15858 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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