Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRK1Q15835 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRK1Q15835 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms