Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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