Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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