Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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