Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHPRHQ149N8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
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