Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ZNF235Q14590 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ZNF235Q14590 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ZNF235Q14590 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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ZNF235Q14590 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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ZNF235Q14590 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF235Q14590 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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ZNF235Q14590 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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ZNF235Q14590 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF235Q14590 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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