Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms