Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BECN1Q14457 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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