Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms