Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ITGA9Q13797 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA9Q13797 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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