Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMB3Q13751 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMB3Q13751 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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