Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms