Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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